但权威的专家认为，经济全球化和贸易自由化是世界经济发展的必然趋势，中国要发挥其应有作用，必须主动参与国际贸易新规则的制定。总的来看，入世为中国农业与农村经济发展提供了难得机遇，对加快实现国家农业现代化将产生积极影响。
首先是有利于扩大农业对外开放。入世后，中国将按照国际规则，进一步完善国内政策法规，优化农业投资环境，开放国内市场，吸引更多的国外资金、技术和管理经验进入农业领域，促使中国农业与国际接轨，加快农业对外开放进程。
其次是有利于农业产业结构和农产品进出口结构的调整。中国劳动力丰富，但耕地资源不足。加入WTO有利于中国进口资源密集型产品，出口劳动密集型产品，资源成本相对较高的玉米、小麦、油料、糖料、大豆和棉花等农作物，在农作物总播种面积和总产量(总产值)中的比例逐渐减少，而蔬菜、部分水果、花卉等园艺作物的比例将有所扩大。畜牧业(除牛奶、羊毛外)将是主要受益行业。
第三，有利于改善中国农产品出口环境。可享受WTO现有成员的无歧视贸易待遇，降低农产品贸易谈判成本和交易成本，并获得解决农产品外贸问题的规范“渠道”，促进我国农产品进入国际市场。
专家同时指出，加入WTO不可避免地要降低关税和取消非关税措施，这无疑对那些质量和单产较低、技术含量不高的农产品及加工品带来一定挑战，在短期内会引发三个方面的问题：一是进一步加重国内主要农产品“卖难”矛盾，加重流通渠道的压力；二是引起国内市场一些农产品价格下跌，引发市场波动，如我国的粮油价格将不再拥有价格优势。由于近年来我国粮油生产的成本平均每年增长10％左右，使我国水稻、小麦、玉米等大宗农作物平均高于国际市场同类产品10％-70％左右。而油料除生产条件落后、单产低、品质差外，油料加工工业生产工艺落后、设备陈旧、出油率低、成本高，使成品油的价格高于国际市场，入关以后，我国的粮油生产面临着极不利的地位。三是影响一些地区农民收入的增加和农业生产的积极性。此外，加入WTO后，会使今后我国在农产品价格保护制度、生产资料价格补贴等方面的农业支持措施受到限制；还有，加入WTO有可能增加我国进口国外农产品的外汇负担。
舆论认为，为减少入世带来的不利影响，中国农业必须采取必要的应对措施。
在当前国际竞争日益加剧的情况下，要保障丰衣足食和食物安全，必须依靠科技进步，把农业科技，特别是发展高新技术放在科技工作的突出位置，推动传统农业向高产、优质、高效的现代农业转变，努力提高我国农业的国际竞争力。重视生物技术在农业上的广泛应用，生物技术可以将所需要的基因组合起来，并与常规育种结合，培育出抗性强、产量高、品质好、营养丰富、生产成本低的转基因的新作物、新品种。生物技术在生产中的广泛应用将使农业科学技术的研究不断出现新的突破和进展。大力保护和有效利用水资源。水资源不足和农业需水量增加的双重压力，使如何提高水资源利用率的工作备受重视，灌溉农业、节水农业和雨养农业、旱地农业目前已成为重要的研究内容。提高科学种植与养殖水平，提高农业生产各个环节的规范化、标准化，由粗放经营向集约经营转变，提高防御自然灾害能力，提高动植物生产力。改进农产品加工、贮运技术，大力发展农产品保鲜、加工、贮运、包装、销售和综合利用等技术，为农业产业化经营提供技术保证，同时大力发展饲料工业和食品工业。
对此，中国国家农业部表示，将重点加强五个方面的工作：加大基础设施建设力度；加强科研和实用技术推广；积极开发和引进新品种新技术；合理调整产业结构；加强经营管理。
专家们认为，从总的和长远看，入世对中国农业是利大于弊，如果措施得当，中国农业在不久的将来会有一个质的飞跃
